El protocolo wixárika que aquí se presenta se integra en cuatro apartados, el primero corresponde al sustento legal que tenemos como pueblo originarios wixárika para desarrollar nuestras propias normas y procedimientos comunitarios, así como el sustento internacional en el marco del Protocolo de Nagoya para desarrollar protocolos comunitarios bioculturales y nuestros sistemas normativos indígenas; la segunda parte describe nuestra comunidad, el territorio, la economía y nuestra organización tradicional y agraria; la tercera integra los objetivos, justificación y metodología; y el cuarto los lineamientos para solicitar un acceso, los lineamientos para establecer las condiciones mutuamente acordadas, la distribución de beneficios y los mecanismos de seguimiento, monitoreo y evaluación, finalmente se integran los anexos, glosario y las referencias bibliográficas.